Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2E2P29084 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms