Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI3P10071 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI3P10071 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI3P10071 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI3P10071 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI3P10071 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms