Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LtaP09225 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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LtaP09225 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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LtaP09225 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtaP09225 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LtaP09225 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LtaP09225 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LtaP09225 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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LtaP09225 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtaP09225 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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