Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNMO15061 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNMO15061 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms