Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCP1A6NGW2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms