Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD1BQ9UPS6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms