Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms