Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU1

BARX1, Homeobox protein BarH-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1Q9HBU1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BARX1Q9HBU1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms