Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ2

Tpd52l2, Tumor protein D54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l2Q9CYZ2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52l2Q9CYZ2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms