Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLF1Q9BQI6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms