Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LRFN4Q6PJG9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRFN4Q6PJG9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms