Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD1Q5VV17 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms