Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms