Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS72Q15906 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms