Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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MTMR3Q13615 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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MTMR3Q13615 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR3Q13615 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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