Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAMK2DQ13557 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAMK2DQ13557 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms