Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACACAQ13085 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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