Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms