Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms