Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP107P57740 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP107P57740 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms