Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRM3A6NNA2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms