Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VTI1BQ9UEU0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms