Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms