Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2J2Q9GZM3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms