Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms