Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAF4Q9BUZ4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms