Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms