Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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