Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sema3cQ62181 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sema3cQ62181 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sema3cQ62181 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sema3cQ62181 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms