Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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