Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SYCP1Q15431 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
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SYCP1Q15431 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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