Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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