Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms