Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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