Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPPAQ13219 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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PAPPAQ13219 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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PAPPAQ13219 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
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PAPPAQ13219 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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PAPPAQ13219 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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PAPPAQ13219 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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PAPPAQ13219 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPPAQ13219 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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