Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms