Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FAM3AP98173 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FAM3AP98173 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FAM3AP98173 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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