Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB1P82279 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB1P82279 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRB1P82279 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms