Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms