Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4BP1P59074 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms