Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
THOP1P52888 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
THOP1P52888 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
THOP1P52888 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THOP1P52888 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THOP1P52888 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THOP1P52888 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
THOP1P52888 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
THOP1P52888 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms