Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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SrprbP47758 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrprbP47758 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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