Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR4P46093 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR4P46093 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR4P46093 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR4P46093 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR4P46093 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR4P46093 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR4P46093 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR4P46093 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR4P46093 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR4P46093 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms