Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 BOLA3P1-201ENST00000530713 355 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LINC02445-201ENST00000551387 459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 NR1H4-209ENST00000551379 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ZNF410-219ENST00000556797 1311 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC090984.1-201ENST00000623172 1332 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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HOXD11P31277 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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HOXD11P31277 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 GLYATL2-202ENST00000532258 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CA5BP1-204ENST00000380336 843 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 DYNC2LI1-204ENST00000406852 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LINC02556-201ENST00000450776 346 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 RPS8P10-201ENST00000460876 622 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PDLIM5-208ENST00000504489 538 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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