Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8BP10966 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms