Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTRA2O43464 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms