Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD9O15198 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms