Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MsmbO08540 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms