Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3C2AO00443 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms