Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFAP73A6NFT4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms